2020年初一场新冠肺炎打破了人们正常生活的节奏，一开始人们把病毒的源头放在蝙蝠身上。 其实这也不难理解，因为在蝙蝠携带的各种病毒中，就有冠状病毒。尽管研究人员后来解释说，新冠病毒与蝙蝠关系不大，但仍不妨碍蝙蝠成为众矢之的。除了冠状病毒，蝙蝠还携带埃博拉病毒、马尔堡病毒、亨德拉病毒、尼帕病毒等病毒。这种病毒传染性强，致病率高。一旦被感染，就很难治愈，尽管蝙蝠携带的病毒种类繁多。
但蝙蝠本身并不致病，如果蝙蝠被彻底消灭，这些病毒的传播可能会加速，人类也不需要将各种原因归咎于蝙蝠，相反蝙蝠对生态环境和人类科学研究具有重要价值。蝙蝠是生态系统的重要组成部分，如果它们被屠杀，其灭绝的后果将是灾难性的。 我们可以看到，人类对自然的过度开发让一些濒临灭绝的物种流离失所，物种的大规模灭绝最终会威胁到人类的生存，再后悔也来不及了。
在生态系统保护方面，食物链关键物种的保护是重中之重。在热带和亚热带原始森林中，蝙蝠中的果蝠在食物链中发挥着重要作用。在热带雨林中，许多幼树无法靠自身吸收养分生长发育。 有的老树甚至会产生毒素阻碍幼树的发育，种子的传播也难以进行，蝙蝠充当了中介。蝙蝠把成熟的果实收集起来，跑到别处去，把吃过果肉的种子随意扔掉。这些种子在远离母亲的地方生根发芽，逐渐长成大树，如此循环往复。 更多的研究表明，一些无花果只能通过果蝠或鸟类在胃消化发芽。
除了对植物生长的好处外，蝙蝠也是食物链的重要组成部分。 蝙蝠主要捕食昆虫，例如蚊子和飞蛾。据统计，蝙蝠每天吃掉相当于体重三分之一的昆虫，蝙蝠反过来为其他食肉动物提供食物。猴子、猛禽和蛇都是蝙蝠的捕食者，它们为这些动物的生存提供优质的蛋白质和能量。
